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新冠病毒到底是不是SARS?一文读懂冠状病毒分类
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来源:上观新闻 作者:朱雅文 李彤彤 2020-02-10 11:13
摘要:原来有这么多冠状病毒!

昨日,在湖北省召开的第十九场疫情防控工作新闻发布会上,华中农业大学教授陈焕春介绍:“分析发现,新型冠状病毒属于SARS冠状病毒”。事后陈焕春教授第一时间表示“口误”、“掉了两个字”,应为“新型冠状病毒属于SARS相关冠状病毒”。

不过,不少人还是摸不着头脑新冠肺炎与SARS到底是什么关系?

首先来了解一下冠状病毒。

冠状病毒是一类具有囊膜的正链单股RNA病毒,其遗传物质是所有RNA病毒中最大的,也是自然界广泛存在的一大类病毒。其粒子形状并不规则,直径约60-220nm。病毒具有包膜结构,上面有三种蛋白。由于其刺突像王冠,因此被称为冠状病毒。

             

“冠状病毒”只是一个统称,所有符合条件的病毒都可以说是“冠状病毒”,如果严谨地从系统分类上来讲,冠状病毒属于冠状病毒科。

1975年,国际病毒命名委员会正式命名了冠状病毒科。在国际病毒分类系统上,统一采用的是目、科、亚科、属、种分类阶元。因此,冠状病毒科又分为两个亚科:Letovirinae亚科和正冠状病毒亚科,而正冠状病毒亚科又下分为α、β、γ和δ四个属。

其中,α和β属涉及人类、家畜和宠物等,病毒种类较多,γ和δ属多是禽类冠状病毒,种类较少。

             

根据国际病毒分类委员会2018b版报告(最新版),已鉴定的人和动物冠状病毒共有23个亚属38个种。虽然有多达38种,但是其中目前已知可感染人类的冠状病毒仅6种——HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV。加上这次的2019-nCoV,一共是7种。

             

说了这么多,那SARS和新冠肺炎是同一种病毒吗?如果不是,那两者究竟是什么关系呢?

首先来明确下SARS在冠状病毒大家族里的定位。

SARS被分类在β属,β属下分为5个亚型12种病毒,他们分别是:β冠状病毒1、黄鼠冠状病毒HKU24、人冠状病毒HKU1、鼠冠状病毒、普氏蹄蝠冠状病毒Zhejiang2013、刺猬冠状病毒1、中东呼吸综合征类病毒(即MERS)、皮皮斯特勒斯蝙蝠冠状病毒HKU5、泰龙蝠HKU4、卢塞图斯蝠冠状病毒GCCDC1、卢塞图斯蝠冠状病毒HKU9和SARS样冠状病毒(即SARS)。

而SARS被分在β属最后一个亚型——Sarbecovirus亚型下,且该亚型下仅SARS一种病毒。

             

数据来源:国际病毒分类委员会2018b版报告

此前(1月30日),《The Lancet》上发表过一篇名为Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding的论文,文中称:系统发育分析表明,人类历史上发现的第7个感染人类的冠状病毒2019-nCoV属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚型,并在遗传学上与SARS-CoV不同,且2019-nCoV与SARS-CoV在RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)基因系统发育上有着明显区别。

简而言之,新冠病毒(2019-nCoV)是一种新的Sarbecovirus亚属的β冠状病毒。

也就是说,2019-nCoV与SARS是同一亚属,意味着具有某些共同特性,但不是同一种病毒。

关于这一点,钟南山院士也在昨晚第一时间表示:新型冠状病毒是冠状病毒的一种,它跟SARS冠状病毒是平行的,二者是同一类(病毒),但不是同一种。

而世界卫生组织官网上就“这一新病毒与SARS一样吗?”这一问题也早已给出过明确答案:“不一样。2019-nCoV与严重急性呼吸综合征病毒(SARS-CoV)属于同一病毒家族,但它们不是同一种病毒。”

             

截图来源:世界卫生组织官网

虽然NCBI(美国国家生物技术信息中心)将2019-nCoV与SARS分在同类,均为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒种,两者基因组序列相似度为80%左右。但从基因组序列相似性上来看,与新冠肺炎基因组序列同源性最高的也并非SARS病毒。

同样是1月30日《The Lancet》上的那篇论文,研究者将2019-nCoV的病毒基因组与其他目前已发现的同为冠状病毒的基因组作了对比,结果表明:2019-nCoV与2018年在中国东部舟山采集的两种蝙蝠源性严重急性呼吸综合征(SARS)样冠状病毒bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21密切相关,基因序列同源性分别达87.99%、87.23%。

             

《The Lancet》:Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding

相比之下,新型冠状病毒与SARS和MERS病毒的序列相似性仅为79%和50%。

参考资料:

 Roujian Lu, Xiang Zhao, Juan Li, et.al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet January 30, 2020

栏目主编:张陌 文字编辑:尤莼洁 题图来源:视觉中国 图片编辑:朱瓅
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